Olympijské hry z roku 1906 v Athénách se ukázaly být mimořádné, protože její organizátoři nesplnili požadavek na tradiční čtyřletou přestávku mezi hrami. Z tohoto důvodu nebyl olympiáda oficiálně uznána ani Mezinárodním olympijským výborem.
Hry z roku 1906 se konaly na počest desátého výročí prvních olympijských her, které se také konaly v Aténách. Aby se ještě více zdůraznil vztah mezi oběma událostmi, organizátoři olympijských her vybrali stejný soutěžní režim jako v roce 1896. Z velké části se soutěže konaly na mramorovém stadionu.
Zpočátku, když v roce 1906 přišel z Řecka návrh na pořádání olympijských her, IOC nedal kategorické odmítnutí. Faktem je, že v té době prestiž olympijských her klesla a veřejnost již o ně neprojevila svůj dřívější zájem. Aby se zabránilo konečnému kolapsu olympijského hnutí, bylo nutné přijmout opatření a nebylo možné čekat až do roku 1908. I když IOC následně odmítá uznat olympijské hry z roku 1906, nazývá se to spása her, které umožnily navrátit zájem veřejnosti a zejména sportovců na akci, aby podpořily hnutí a jeho samotnou myšlenku.
Obtížnost také spočívala v tom, že podle tradice se olympijské hry měly konat v různých zemích světa, ale v roce 1906 se měla akce konat v Řecku, což způsobilo nespokojenost členů MOV. Tak či onak, ale 22. dubna se konalo slavnostní otevření her. Protože média věnovala velkou pozornost olympiádě v roce 1906, přijelo do Atén mnoho atletů a hostů.
Akce se zúčastnilo asi 900 sportovců z 20 zemí, mezi nimi sedm žen. V rámci olympijských her z roku 1906 se konaly soutěže v těchto sportech: vzpírání, řecko-římský zápas, šerm, veslování, plachtění, plavání, potápění, atletika, střílení na lavičce a kulky, cyklistika a tenis. Bohužel, protože MOV neuznal olympijské hry z roku 1906, všechna ocenění, která jeho účastníci obdrželi, byla neplatná a v budoucnu nebyla brána v úvahu.
Slavnostní zakončení olympijských her se konalo 2. května. Po skončení akce byly její výsledky diskutovány po dlouhou dobu v různých zemích, což výrazně zvýšilo zájem veřejnosti o hry. Toto bylo zvláště patrné během olympijských her v roce 1908 v Londýně, kterých se zúčastnilo více než 2 000 sportovců.